Международный генетический консорциум опубликовал в журнале
Nature объединенные
данные по 46 исследованиям генетической предрасположенности заболеть ковидом в
тяжелой форме. По результатам самого крупного на сегодняшний день метаанализа
исследователи выделили 13 генетических локусов, ассоциированных с повышенной
вероятностью подхватить инфекцию.
С момента начала циркуляции в человеческой популяции вируса SARS-CoV-2 стало ясно, что некоторые факторы,
такие как преклонный возраст или лишний вес, повышают риск развития более
тяжелой формы заболевания. Кроме того, риск тяжело заболеть выше у мужчин, чем
у женщин. Тем не менее иногда люди легко переносят болезнь даже при наличии
факторов риска, а иногда наоборот. Возможная причина этого может заключаться в
генетической предрасположенности к развитию осложнений.
С момента начала эпидемии ученые занялись поиском ассоциаций
между известными генетическими полиморфизмами и вероятностью заболеть ковидом,
переболеть в тяжелой форме или умереть. Данные по отдельным европейским выборкам
уже показали, что к тяжелой форме более склонны носители некоторых вариантов,
связанных также с группой крови, болезнями легких и воспалением. Тем не менее, для
установления более надежных ассоциаций требуются большие массивы данных.
В свежей статье генетики из 19 стран, объединенные проектом COVID-19 HGI (COVID-19 Host Genetics Initiative),
обнародовали данные метаанализа 46 отдельных исследований, объединяющих почти
50 тысяч переболевших ковидом (или умерших от него) людей и два миллиона
контролей. Такая выборка позволила бы отделить социоэкономические факторы,
такие как доступ к медицинской помощи, от истинного вклада генов в вероятность заболеть.
Российская популяция тоже попала в эту выборку благодаря нескольким небольшим
исследованиям, проведенным в партнерстве с коммерческими фирмами.
Суммарную выборку разделили на три группы: переболевшие
ковидом (с подтвержденным диагнозом, или с собственных слов),
госпитализированные с ковидом (только с подтвержденным диагнозом) и
госпитализированные с критической формой заболевания, которая потребовала
искусственной вентиляции легких или закончилась смертью пациента. Из 49562
больных были госпитализированы с умеренной и тяжелой формой 7462 человека и в
критическом состоянии 6179 человек. Около 80 процентов больных были европейского
происхождения, однако в анализ также вошли люди с африканскими и азиатскими
корнями. В качестве контроля были взяты суммарно два миллиона образцов ДНК в
пропорциональном этническом соотношении, вне зависимости от того, болели эти
люди ковидом, или нет.
Анализ был проведен методом установления полногеномных
ассоциаций между отдельными полиморфизмами (вариантами последовательности ДНК)
и вероятностью оказаться в одной из трех групп. В итоге исследователи
обнаружили 13 генетических локусов, ассоциированных с вероятностью заболеть в
той или иной форме, как ранее идентифицированных, так и новых.
Девять из них
оказались связаны именно с тяжелой формой болезни. К примеру, один такой локус,
— полиморфизм в гене TYK2, — связали с общим снижением функций иммунитета. Два
других полиморфизма, положительно ассоциированных с вероятностью очень тяжело
заболеть (в генах DPP9 и
FOXP4), ранее связывали
с повышением риска развития других болезней легких, в том числе аденокарциномы.
Две найденных ассоциации оказались связаны только с азиатской популяцией, что
лишний раз подчеркнуло необходимость включения в подобные анализы людей разного
происхождения.
Кроме того, анализ собранных данных позволил уточнить роль
лишнего веса и курения в склонности к заболеванию ковидом. Используя
менделевскую рандомизацию, генетики установили причинно-следственную связь
между генетической склонностью к повышенному индексу массы тела и вероятностью заболеть.
Склонность к курению оказалась связана с повышением вероятности госпитализации.
Генетические исследования в первую очередь могут
помочь более точно очертить группы риска, а также пополняют информацию о
факторах, влияющих на развитие инфекции. Подробный гид по пандемии ковида по
состоянию на весну 2021 года можно прочитать здесь.
Дарья Спасская
Источник
Автор: Доктор Хаус